ปริมาณน้ำในเนื้อผลไม้เห็ดสูงมากประมาณ 90% ในการเพาะเห็ดจริงควรควบคุมความชื้นของวัสดุเพาะเลี้ยงที่ 55% ~ 60% หากสภาพแวดล้อมแห้งเกินไปการเจริญเติบโตของเห็ดจะได้รับผลกระทบอย่างรุนแรง หากมีความชื้นมากเกินไปก็จะส่งผลต่อการไหลเวียนของอากาศและเนื้อผลไม้และเส้นใยจะค่อยๆตาย ดังนั้นการควบคุมความชื้นจึงต้องแม่นยำมากซึ่งเป็นปัญหาที่ต้องเอาใจใส่ในการเพาะปลูกจริงและหลักการสำคัญที่ต้องปฏิบัติตามในการเพาะเห็ด
